Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SncaO55042 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SncaO55042 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SncaO55042 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SncaO55042 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SncaO55042 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SncaO55042 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SncaO55042 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SncaO55042 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SncaO55042 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SncaO55042 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SncaO55042 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SncaO55042 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SncaO55042 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SncaO55042 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SncaO55042 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SncaO55042 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SncaO55042 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SncaO55042 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SncaO55042 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SncaO55042 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SncaO55042 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SncaO55042 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SncaO55042 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SncaO55042 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SncaO55042 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SncaO55042 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SncaO55042 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SncaO55042 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SncaO55042 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SncaO55042 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SncaO55042 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SncaO55042 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SncaO55042 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SncaO55042 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SncaO55042 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SncaO55042 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SncaO55042 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SncaO55042 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SncaO55042 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SncaO55042 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SncaO55042 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaO55042 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaO55042 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaO55042 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaO55042 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaO55042 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaO55042 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaO55042 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaO55042 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SncaO55042 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaO55042 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaO55042 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaO55042 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaO55042 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaO55042 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SncaO55042 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaO55042 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaO55042 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaO55042 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaO55042 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SncaO55042 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaO55042 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaO55042 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaO55042 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaO55042 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaO55042 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaO55042 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaO55042 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaO55042 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaO55042 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SncaO55042 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaO55042 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaO55042 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaO55042 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaO55042 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaO55042 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaO55042 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SncaO55042 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaO55042 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaO55042 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaO55042 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaO55042 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaO55042 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SncaO55042 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaO55042 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaO55042 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaO55042 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaO55042 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SncaO55042 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncaO55042 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncaO55042 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncaO55042 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncaO55042 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncaO55042 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SncaO55042 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncaO55042 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncaO55042 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncaO55042 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SncaO55042 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms