Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn5O54942 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn5O54942 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn5O54942 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn5O54942 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn5O54942 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms