Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb3O54890 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb3O54890 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb3O54890 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb3O54890 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb3O54890 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms