Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TsksO54887 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TsksO54887 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TsksO54887 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TsksO54887 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TsksO54887 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TsksO54887 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TsksO54887 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TsksO54887 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TsksO54887 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TsksO54887 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TsksO54887 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TsksO54887 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TsksO54887 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TsksO54887 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TsksO54887 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TsksO54887 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TsksO54887 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TsksO54887 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TsksO54887 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TsksO54887 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TsksO54887 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TsksO54887 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TsksO54887 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TsksO54887 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TsksO54887 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TsksO54887 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TsksO54887 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TsksO54887 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TsksO54887 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TsksO54887 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TsksO54887 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TsksO54887 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TsksO54887 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TsksO54887 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TsksO54887 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TsksO54887 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TsksO54887 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TsksO54887 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TsksO54887 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TsksO54887 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TsksO54887 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TsksO54887 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TsksO54887 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TsksO54887 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TsksO54887 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TsksO54887 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TsksO54887 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TsksO54887 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TsksO54887 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TsksO54887 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TsksO54887 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TsksO54887 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TsksO54887 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TsksO54887 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TsksO54887 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TsksO54887 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TsksO54887 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TsksO54887 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TsksO54887 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TsksO54887 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TsksO54887 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TsksO54887 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TsksO54887 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TsksO54887 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TsksO54887 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TsksO54887 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TsksO54887 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TsksO54887 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TsksO54887 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TsksO54887 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TsksO54887 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TsksO54887 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TsksO54887 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TsksO54887 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TsksO54887 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TsksO54887 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TsksO54887 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TsksO54887 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TsksO54887 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TsksO54887 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TsksO54887 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TsksO54887 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TsksO54887 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TsksO54887 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TsksO54887 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TsksO54887 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TsksO54887 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TsksO54887 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TsksO54887 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TsksO54887 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TsksO54887 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TsksO54887 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TsksO54887 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TsksO54887 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TsksO54887 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TsksO54887 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TsksO54887 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TsksO54887 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TsksO54887 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.4 ms