Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atp10aO54827 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Atp10aO54827 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atp10aO54827 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Atp10aO54827 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Atp10aO54827 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Atp10aO54827 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms