Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkaO54804 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ChkaO54804 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ChkaO54804 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkaO54804 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkaO54804 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkaO54804 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ChkaO54804 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkaO54804 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ChkaO54804 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkaO54804 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChkaO54804 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChkaO54804 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ChkaO54804 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms