Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A2O43868 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC28A2O43868 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC28A2O43868 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A2O43868 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms