Protein–RNA interactions for Protein: O43837

IDH3B, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3BO43837 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IDH3BO43837 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IDH3BO43837 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IDH3BO43837 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IDH3BO43837 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms