Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENRO43583 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENRO43583 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENRO43583 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENRO43583 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENRO43583 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENRO43583 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENRO43583 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENRO43583 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENRO43583 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENRO43583 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENRO43583 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENRO43583 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENRO43583 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENRO43583 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENRO43583 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENRO43583 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENRO43583 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENRO43583 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENRO43583 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DENRO43583 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENRO43583 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENRO43583 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENRO43583 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENRO43583 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENRO43583 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENRO43583 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENRO43583 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENRO43583 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENRO43583 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENRO43583 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENRO43583 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENRO43583 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENRO43583 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENRO43583 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENRO43583 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENRO43583 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DENRO43583 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENRO43583 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DENRO43583 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENRO43583 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENRO43583 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENRO43583 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENRO43583 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENRO43583 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENRO43583 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENRO43583 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENRO43583 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENRO43583 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DENRO43583 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENRO43583 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DENRO43583 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENRO43583 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENRO43583 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENRO43583 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENRO43583 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENRO43583 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENRO43583 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENRO43583 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENRO43583 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENRO43583 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENRO43583 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENRO43583 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DENRO43583 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENRO43583 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENRO43583 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENRO43583 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENRO43583 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DENRO43583 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENRO43583 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENRO43583 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENRO43583 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENRO43583 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENRO43583 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENRO43583 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENRO43583 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DENRO43583 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENRO43583 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENRO43583 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENRO43583 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENRO43583 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENRO43583 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENRO43583 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENRO43583 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENRO43583 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENRO43583 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENRO43583 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DENRO43583 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENRO43583 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENRO43583 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENRO43583 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENRO43583 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENRO43583 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENRO43583 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENRO43583 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DENRO43583 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENRO43583 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENRO43583 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENRO43583 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DENRO43583 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms