Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMAD6O43541 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMAD6O43541 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMAD6O43541 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms