Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA2O43464 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HTRA2O43464 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTRA2O43464 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2747.9 ms