Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATMINO43313 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATMINO43313 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATMINO43313 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATMINO43313 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATMINO43313 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATMINO43313 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATMINO43313 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATMINO43313 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATMINO43313 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATMINO43313 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATMINO43313 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATMINO43313 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATMINO43313 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATMINO43313 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATMINO43313 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATMINO43313 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATMINO43313 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATMINO43313 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMINO43313 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMINO43313 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMINO43313 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMINO43313 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMINO43313 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMINO43313 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMINO43313 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMINO43313 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMINO43313 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATMINO43313 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATMINO43313 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATMINO43313 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATMINO43313 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATMINO43313 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATMINO43313 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATMINO43313 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATMINO43313 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATMINO43313 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATMINO43313 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATMINO43313 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATMINO43313 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATMINO43313 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATMINO43313 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATMINO43313 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATMINO43313 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATMINO43313 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATMINO43313 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATMINO43313 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATMINO43313 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATMINO43313 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATMINO43313 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATMINO43313 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATMINO43313 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATMINO43313 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATMINO43313 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMINO43313 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMINO43313 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMINO43313 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMINO43313 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMINO43313 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMINO43313 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMINO43313 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMINO43313 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMINO43313 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATMINO43313 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATMINO43313 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATMINO43313 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATMINO43313 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATMINO43313 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATMINO43313 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATMINO43313 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATMINO43313 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATMINO43313 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATMINO43313 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATMINO43313 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATMINO43313 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATMINO43313 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms