Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF9O43307 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF9O43307 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms