Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAP3K13O43283 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MAP3K13O43283 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MAP3K13O43283 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms