Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC11O43248 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXC11O43248 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC11O43248 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC11O43248 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXC11O43248 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC11O43248 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC11O43248 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC11O43248 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC11O43248 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC11O43248 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC11O43248 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC11O43248 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC11O43248 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms