Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klf9O35739 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klf9O35739 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf9O35739 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf9O35739 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf9O35739 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf9O35739 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klf9O35739 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf9O35739 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf9O35739 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf9O35739 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf9O35739 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf9O35739 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf9O35739 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf9O35739 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf9O35739 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf9O35739 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf9O35739 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf9O35739 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf9O35739 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf9O35739 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf9O35739 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf9O35739 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms