Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn6O35646 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn6O35646 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Capn6O35646 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn6O35646 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn6O35646 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn6O35646 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn6O35646 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn6O35646 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn6O35646 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn6O35646 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn6O35646 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn6O35646 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn6O35646 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn6O35646 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn6O35646 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn6O35646 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn6O35646 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn6O35646 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms