Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cpsf2O35218 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpsf2O35218 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpsf2O35218 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms