Protein–RNA interactions for Protein: O15427

SLC16A3, Monocarboxylate transporter 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A3O15427 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC16A3O15427 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC16A3O15427 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC16A3O15427 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC16A3O15427 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC16A3O15427 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC16A3O15427 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC16A3O15427 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC16A3O15427 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC16A3O15427 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC16A3O15427 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC16A3O15427 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms