Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMAD9O15198 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMAD9O15198 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD9O15198 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD9O15198 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD9O15198 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD9O15198 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms