Protein–RNA interactions for Protein: O15164

TRIM24, Transcription intermediary factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM24O15164 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM24O15164 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM24O15164 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM24O15164 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM24O15164 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms