Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP290O15078 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CEP290O15078 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP290O15078 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP290O15078 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP290O15078 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP290O15078 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP290O15078 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP290O15078 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP290O15078 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CEP290O15078 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP290O15078 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP290O15078 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CEP290O15078 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP290O15078 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP290O15078 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CEP290O15078 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CEP290O15078 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP290O15078 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CEP290O15078 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP290O15078 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP290O15078 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP290O15078 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP290O15078 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CEP290O15078 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP290O15078 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP290O15078 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP290O15078 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CEP290O15078 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP290O15078 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP290O15078 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP290O15078 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP290O15078 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP290O15078 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CEP290O15078 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP290O15078 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CEP290O15078 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP290O15078 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP290O15078 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP290O15078 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP290O15078 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CEP290O15078 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP290O15078 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP290O15078 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP290O15078 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP290O15078 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP290O15078 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP290O15078 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CEP290O15078 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP290O15078 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP290O15078 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP290O15078 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP290O15078 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CEP290O15078 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP290O15078 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP290O15078 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP290O15078 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP290O15078 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CEP290O15078 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP290O15078 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP290O15078 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP290O15078 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP290O15078 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP290O15078 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP290O15078 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP290O15078 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP290O15078 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP290O15078 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP290O15078 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CEP290O15078 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP290O15078 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP290O15078 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP290O15078 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP290O15078 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP290O15078 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CEP290O15078 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP290O15078 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP290O15078 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP290O15078 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP290O15078 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP290O15078 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CEP290O15078 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP290O15078 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP290O15078 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP290O15078 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP290O15078 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CEP290O15078 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP290O15078 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CEP290O15078 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP290O15078 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP290O15078 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CEP290O15078 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP290O15078 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP290O15078 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP290O15078 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP290O15078 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CEP290O15078 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP290O15078 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP290O15078 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP290O15078 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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