Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
WNT9AO14904 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
WNT9AO14904 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WNT9AO14904 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms