Protein–RNA interactions for Protein: O09053

Wrn, Werner syndrome ATP-dependent helicase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WrnO09053 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
WrnO09053 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
WrnO09053 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
WrnO09053 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
WrnO09053 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
WrnO09053 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
WrnO09053 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
WrnO09053 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
WrnO09053 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
WrnO09053 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
WrnO09053 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
WrnO09053 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
WrnO09053 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
WrnO09053 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
WrnO09053 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
WrnO09053 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
WrnO09053 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
WrnO09053 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
WrnO09053 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
WrnO09053 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
WrnO09053 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
WrnO09053 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
WrnO09053 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
WrnO09053 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
WrnO09053 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
WrnO09053 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
WrnO09053 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
WrnO09053 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
WrnO09053 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
WrnO09053 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
WrnO09053 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
WrnO09053 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
WrnO09053 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
WrnO09053 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
WrnO09053 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
WrnO09053 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
WrnO09053 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
WrnO09053 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
WrnO09053 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
WrnO09053 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
WrnO09053 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
WrnO09053 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
WrnO09053 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
WrnO09053 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
WrnO09053 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
WrnO09053 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
WrnO09053 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
WrnO09053 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
WrnO09053 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
WrnO09053 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
WrnO09053 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
WrnO09053 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
WrnO09053 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
WrnO09053 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
WrnO09053 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
WrnO09053 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
WrnO09053 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
WrnO09053 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
WrnO09053 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
WrnO09053 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
WrnO09053 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
WrnO09053 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
WrnO09053 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
WrnO09053 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
WrnO09053 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
WrnO09053 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
WrnO09053 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
WrnO09053 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
WrnO09053 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
WrnO09053 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
WrnO09053 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
WrnO09053 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
WrnO09053 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
WrnO09053 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
WrnO09053 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
WrnO09053 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
WrnO09053 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
WrnO09053 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
WrnO09053 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
WrnO09053 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
WrnO09053 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
WrnO09053 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
WrnO09053 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
WrnO09053 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
WrnO09053 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
WrnO09053 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
WrnO09053 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
WrnO09053 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
WrnO09053 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
WrnO09053 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
WrnO09053 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
WrnO09053 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
WrnO09053 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
WrnO09053 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
WrnO09053 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
WrnO09053 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
WrnO09053 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
WrnO09053 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
WrnO09053 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
WrnO09053 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.5 ms