Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PIK3C2BO00750 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PIK3C2BO00750 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PIK3C2BO00750 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PIK3C2BO00750 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms