Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME4O00746 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME4O00746 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME4O00746 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME4O00746 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NME4O00746 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME4O00746 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME4O00746 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME4O00746 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NME4O00746 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NME4O00746 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME4O00746 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME4O00746 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME4O00746 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME4O00746 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME4O00746 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME4O00746 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NME4O00746 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME4O00746 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NME4O00746 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME4O00746 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME4O00746 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME4O00746 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME4O00746 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME4O00746 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME4O00746 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME4O00746 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME4O00746 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME4O00746 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME4O00746 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME4O00746 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME4O00746 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME4O00746 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME4O00746 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME4O00746 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME4O00746 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME4O00746 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME4O00746 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME4O00746 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME4O00746 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME4O00746 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME4O00746 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME4O00746 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME4O00746 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME4O00746 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME4O00746 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME4O00746 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME4O00746 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME4O00746 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME4O00746 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME4O00746 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME4O00746 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME4O00746 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NME4O00746 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NME4O00746 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME4O00746 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NME4O00746 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME4O00746 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME4O00746 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME4O00746 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME4O00746 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME4O00746 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME4O00746 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME4O00746 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NME4O00746 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME4O00746 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME4O00746 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME4O00746 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME4O00746 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME4O00746 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NME4O00746 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME4O00746 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NME4O00746 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME4O00746 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME4O00746 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME4O00746 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NME4O00746 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME4O00746 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME4O00746 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME4O00746 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME4O00746 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NME4O00746 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME4O00746 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME4O00746 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME4O00746 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME4O00746 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME4O00746 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NME4O00746 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME4O00746 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME4O00746 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME4O00746 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NME4O00746 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME4O00746 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME4O00746 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME4O00746 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NME4O00746 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME4O00746 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NME4O00746 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME4O00746 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NME4O00746 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1011.6 ms