Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP1O00294 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP1O00294 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP1O00294 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP1O00294 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP1O00294 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP1O00294 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP1O00294 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP1O00294 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP1O00294 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP1O00294 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP1O00294 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP1O00294 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP1O00294 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP1O00294 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP1O00294 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP1O00294 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP1O00294 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TULP1O00294 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP1O00294 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP1O00294 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TULP1O00294 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP1O00294 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP1O00294 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP1O00294 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP1O00294 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP1O00294 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP1O00294 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP1O00294 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP1O00294 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP1O00294 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP1O00294 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TULP1O00294 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP1O00294 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP1O00294 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP1O00294 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP1O00294 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP1O00294 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP1O00294 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP1O00294 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP1O00294 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP1O00294 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP1O00294 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP1O00294 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP1O00294 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP1O00294 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
TULP1O00294 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP1O00294 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP1O00294 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP1O00294 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP1O00294 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP1O00294 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP1O00294 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP1O00294 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP1O00294 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP1O00294 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP1O00294 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP1O00294 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TULP1O00294 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP1O00294 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP1O00294 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP1O00294 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP1O00294 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP1O00294 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP1O00294 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP1O00294 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP1O00294 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP1O00294 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP1O00294 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP1O00294 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP1O00294 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP1O00294 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP1O00294 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP1O00294 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP1O00294 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TULP1O00294 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP1O00294 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP1O00294 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP1O00294 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP1O00294 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TULP1O00294 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP1O00294 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP1O00294 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP1O00294 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP1O00294 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP1O00294 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP1O00294 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP1O00294 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP1O00294 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP1O00294 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP1O00294 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP1O00294 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP1O00294 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP1O00294 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP1O00294 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP1O00294 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP1O00294 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP1O00294 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP1O00294 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP1O00294 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms