Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
SUPT5HO00267 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC44.06■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
SUPT5HO00267 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC44■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC43.95■■■■■ 4.63
SUPT5HO00267 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC43.91■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
SUPT5HO00267 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC43.87■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC43.85■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms