Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vwa3bJ9JI28 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vwa3bJ9JI28 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Vwa3bJ9JI28 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Vwa3bJ9JI28 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vwa3bJ9JI28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vwa3bJ9JI28 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vwa3bJ9JI28 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vwa3bJ9JI28 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vwa3bJ9JI28 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vwa3bJ9JI28 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms