Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QQQ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QQQ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QQQ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QQQ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QQQ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QQQ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QQQ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
J3QQQ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QQQ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QQQ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QQQ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QQQ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QQQ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QQQ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QQQ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QQQ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QQQ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QQQ9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
J3QQQ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QQQ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QQQ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QQQ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QQQ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QQQ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QQQ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QQQ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QQQ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
J3QQQ9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
J3QQQ9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QQQ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QQQ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QQQ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QQQ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QQQ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
J3QQQ9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
J3QQQ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3QQQ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3QQQ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3QQQ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3QQQ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3QQQ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3QQQ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3QQQ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
J3QQQ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QQQ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QQQ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QQQ9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QQQ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QQQ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QQQ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QQQ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QQQ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QQQ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
J3QQQ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QQQ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QQQ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QQQ9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QQQ9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QQQ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
J3QQQ9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QQQ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QQQ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QQQ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QQQ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QQQ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QQQ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QQQ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QQQ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QQQ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QQQ9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
J3QQQ9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QQQ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QQQ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
J3QQQ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms