Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20795J3QP49 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20795J3QP49 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20795J3QP49 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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