Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mfsd4b4J3QNS5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Mfsd4b4J3QNS5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mfsd4b4J3QNS5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms