Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20918J3QN17 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm20918J3QN17 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gm20918J3QN17 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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