Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
J3QLW9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QLW9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QLW9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QLW9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QLW9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QLW9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QLW9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QLW9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QLW9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QLW9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QLW9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
J3QLW9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QLW9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QLW9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QLW9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QLW9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
J3QLW9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QLW9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QLW9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QLW9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QLW9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QLW9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QLW9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
J3QLW9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
J3QLW9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QLW9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QLW9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QLW9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QLW9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QLW9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QLW9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QLW9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QLW9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QLW9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QLW9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
J3QLW9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QLW9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QLW9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QLW9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QLW9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QLW9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
J3QLW9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QLW9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QLW9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QLW9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QLW9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QLW9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QLW9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
J3QLW9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QLW9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QLW9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QLW9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QLW9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3QLW9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
J3QLW9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QLW9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QLW9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QLW9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QLW9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QLW9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QLW9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
J3QLW9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QLW9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QLW9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3QLW9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QLW9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QLW9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QLW9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3QLW9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QLW9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QLW9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QLW9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QLW9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3QLW9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QLW9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QLW9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QLW9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QLW9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QLW9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3QLW9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QLW9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QLW9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QLW9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QLW9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QLW9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QLW9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QLW9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QLW9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3QLW9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QLW9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3QLW9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QLW9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3QLW9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3QLW9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3QLW9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QLW9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QLW9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QLW9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
J3QLW9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms