Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QKU1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QKU1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QKU1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QKU1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QKU1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QKU1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QKU1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QKU1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
J3QKU1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
J3QKU1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QKU1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QKU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QKU1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QKU1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QKU1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QKU1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QKU1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
J3QKU1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QKU1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QKU1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QKU1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
J3QKU1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QKU1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QKU1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QKU1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QKU1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QKU1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QKU1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QKU1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
J3QKU1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QKU1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QKU1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QKU1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
J3QKU1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QKU1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QKU1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QKU1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QKU1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
J3QKU1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QKU1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QKU1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QKU1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QKU1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
J3QKU1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QKU1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QKU1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QKU1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
J3QKU1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QKU1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QKU1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QKU1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QKU1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
J3QKU1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QKU1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QKU1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QKU1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QKU1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QKU1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
J3QKU1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QKU1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QKU1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QKU1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
J3QKU1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QKU1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QKU1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QKU1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
J3QKU1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QKU1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QKU1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QKU1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QKU1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QKU1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QKU1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
J3QKU1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QKU1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QKU1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QKU1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
J3QKU1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QKU1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3QKU1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QKU1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QKU1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QKU1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QKU1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QKU1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QKU1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QKU1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QKU1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3QKU1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3QKU1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3QKU1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3QKU1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3QKU1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QKU1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QKU1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QKU1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QKU1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QKU1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QKU1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms