Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cldn34c3J3QJW5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn34c3J3QJW5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn34c3J3QJW5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn34c3J3QJW5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms