Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21820J3KMU2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21820J3KMU2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21820J3KMU2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21820J3KMU2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms