Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CROCC2H7BZ55 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
CROCC2H7BZ55 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CROCC2H7BZ55 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms