Protein–RNA interactions for Protein: H3BSH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSH0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSH0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSH0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSH0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSH0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSH0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSH0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSH0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSH0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSH0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSH0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSH0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSH0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSH0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSH0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSH0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSH0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSH0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
H3BSH0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSH0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSH0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSH0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSH0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSH0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSH0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSH0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSH0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSH0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSH0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSH0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSH0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSH0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSH0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSH0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSH0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSH0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BSH0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BSH0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BSH0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BSH0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BSH0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BSH0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BSH0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BSH0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BSH0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BSH0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BSH0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BSH0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BSH0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BSH0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BSH0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BSH0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BSH0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BSH0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BSH0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BSH0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3BSH0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BSH0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BSH0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BSH0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BSH0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3BSH0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BSH0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BSH0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BSH0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BSH0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3BSH0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BSH0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BSH0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3BSH0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BSH0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BSH0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BSH0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BSH0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BSH0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BSH0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BSH0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H3BSH0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BSH0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BSH0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BSH0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BSH0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BSH0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H3BSH0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BSH0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BSH0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BSH0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BSH0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BSH0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BSH0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BSH0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BSH0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BSH0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H3BSH0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BSH0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BSH0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H3BSH0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BSH0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BSH0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H3BSH0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms