Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC2LH3BP13 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC2LH3BP13 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC2LH3BP13 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms