Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BNX3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BNX3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3BNX3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BNX3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BNX3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3BNX3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BNX3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BNX3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BNX3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNX3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNX3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNX3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNX3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNX3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNX3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNX3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNX3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BNX3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BNX3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BNX3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BNX3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BNX3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BNX3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BNX3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BNX3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BNX3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BNX3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BNX3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BNX3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BNX3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BNX3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BNX3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BNX3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BNX3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BNX3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BNX3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BNX3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BNX3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BNX3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BNX3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BNX3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BNX3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNX3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNX3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNX3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNX3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNX3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BNX3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNX3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNX3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNX3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNX3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNX3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNX3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNX3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNX3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BNX3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BNX3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BNX3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BNX3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BNX3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BNX3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BNX3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BNX3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BNX3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BNX3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BNX3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BNX3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BNX3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BNX3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BNX3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BNX3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BNX3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H3BNX3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BNX3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BNX3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BNX3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BNX3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BNX3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BNX3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BNX3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BNX3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H3BNX3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BNX3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BNX3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BNX3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BNX3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BNX3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BNX3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H3BNX3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BNX3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BNX3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BNX3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BNX3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H3BNX3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BNX3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BNX3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BNX3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BNX3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms