Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP4-16G5E9R7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms