Protein–RNA interactions for Protein: G5E845

Kcnk16, MCG5959, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk16G5E845 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnk16G5E845 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcnk16G5E845 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnk16G5E845 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnk16G5E845 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms