Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pcf11G3X9Z4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pcf11G3X9Z4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Pcf11G3X9Z4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Pcf11G3X9Z4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms