Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm8909G3UXE9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm8909G3UXE9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm8909G3UXE9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm8909G3UXE9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms