Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20517G3UVU6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20517G3UVU6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms