Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NpcdF8VQB8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NpcdF8VQB8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NpcdF8VQB8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NpcdF8VQB8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms