Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp9yF8VPU6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp9yF8VPU6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp9yF8VPU6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms