Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh9F8VPK8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh9F8VPK8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdh9F8VPK8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh9F8VPK8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms