Protein–RNA interactions for Protein: F6TUL9

Vsig4, V-set and immunoglobulin domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig4F6TUL9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vsig4F6TUL9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsig4F6TUL9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig4F6TUL9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsig4F6TUL9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig4F6TUL9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig4F6TUL9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig4F6TUL9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig4F6TUL9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig4F6TUL9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig4F6TUL9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsig4F6TUL9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms